Patrones de resistencia a antibióticos de Acinetobacter baumannii en un hospital de Colombia / Patterns of Acinetobacter baumannii resistance to antibiotics in a Colombian hospital

Identificar patrones de resistencia en los aislamientos de A. baumannii obtenidos en una unidad de cuidados intensivos de Cali, Colombia. Diseño: Estudio descriptivo, prospectivo de corte transversal. Institución: Clínica Universitaria Rafael Uribe Uribe, Cali, Colombia. Materiales: Los aislamientos se obtuvieron de cultivos de muestras de sangre, heridas quirúrgicas, secreción nasal, orina, secreción uretral y puntas de catéter. Intervenciones: Se recolectaron 52 aislamientos durante los años 2009 y 2010. Mediante el análisis del antibiograma se identificaron patrones de resistencia (antibiotipos), se realizó antibiograma cuantitativo y se construyó un cladograma basado en el agrupamiento por el método de promedios aritméticos de grupos apareados no ponderados (conocido en inglés como UPGMA). Principales medidas de resultados: Medida de la concentración mínima inhibitoria (CMI) y el coeficiente de similitud generado por las distancias de los diámetros de los halos de inhibición entre dos aislamientos (antibiograma cuantitativo). Resultados: Se identificaron 5 antibiotipos; el 50 por ciento de los aislamientos se agruparon en el antibiotipo 1, con resistencia a todos los antibióticos y sensibilidad a tigeciclina y sulperazona; el antibiotipo 4 agrupó los aislamientos con resistencia a todos los antibióticos (19,3 por ciento). En el antibiograma cuantitativo se identificaron dos clados con 5 y 47 aislamientos, respectivamente. Conclusiones: Los aislamientos de Acinetobacter baumannii tuvieron pocas diferencias fenotípicas y es probable que presenten alguna de las ß-lactamasas tipo OXA...

To identify patterns of resistance in A. baumannii isolates obtained from an intensive care unit in Cali, Colombia. Design: Prospective cross-sectional descriptive study. Institution: Clínica Universitaria Rafael Uribe Uribe, Cali, Colombia. Materials: Isolates were obtained from cultures of blood, surgical wounds, nasal secretion, urine, urethral discharge and catheter tip samples. Interventions: Fifty-two isolates were collected between 2009 and 2010. Antibiogram analysis was done to identify resistance patterns (antibiotypes), a quantitative susceptibility testing was conducted, and a cladogram based on unweighted pair group method average (UPGMA) was constructed. Main outcome measures: Minimum inhibitory concentration (MIC) and similarity coefficient generated by diameters distances between two isolated inhibition zones (quantitative antibiogram). Results: Five antibiotypes were identified; 50 per cent of isolates were grouped in antibiotype 1, were resistant to all antibiotics, and susceptible to tigecycline and sulperazone; antibiotype 4 grouped isolates resistant to all antibiotics (19.3 per cent). In the quantitative antibiogram two clades with 5 and 47 isolates were identified respectively. Conclusions: Acinetobacter baumannii isolates showed few phenotypic differences and probably present some of ß-lactamases OXA type...

Caracterización fenotípica de aislamientos de Acinetobacter baumannii en una institución de salud de alta complejidad de Cali / Phenotypic characterization of Acinetobacter baumannii isolates in a high-complexity healthcare institution in the city of Cali

Introducción. La caracterización fenotípica de las bacterias del género Acinetobacter mediante pruebas bioquímicas y microscópicas es posible. Varios estudios han demostrado que los aislamientos provenientes de infecciones asociadas a la atención en salud presentan una elevada resistencia a los antibióticos de primera elección. Objetivo. Describir los patrones de resistencia de los aislamientos de Acinetobacter baumannii obtenidos en una institución de salud, así como sus características fenotípicas y los posibles mecanismos de resistencia. Materiales y métodos. Se realizó un estudio descriptivo de corte transversal con 28 informes de muestras tomadas a pacientes hospitalizados con infección por A. baumannii . Las pruebas de sensibilidad para ceftazidime, cefepime, meropenem, amikacina y ciprofloxacina se realizaron con el sistema automatizado Vitek ® y la clasificación de sensible, intermedia y resistente se hizo con base en el protocolo establecido por el Clinical and Laboratory Standards Institute para el año 2007. Resultados. El mayor porcentaje de aislamientos correspondió al sexo masculino (53,6 %), a la sala de infectología (28,5 %) y al mes de septiembre (21,4 %); el tipo de muestra más frecuente fue el de secreción endotraqueal (53,6 %). A partir de los patrones de los perfiles de sensibilidad a los antibióticos empleados se obtuvieron 13 filotipos. Conclusión. Acinetobacter baumannii es un agente patógeno resistente a múltiples antimicrobianos, involucrado en brotes de infecciones asociadas a la atención en salud. Los patrones de los perfiles de resistencia permiten inferir que los posibles mecanismos de resistencia presentes en la mayoría de los aislamientos son la producción de betalactamasas de espectro extendido, las enzimas modificadoras del antibiótico y la modificación del sitio diana.

Introduction: Phenotypic characterization of the Acinetobacter genus bacteria through biochemical and microscopic tests is possible. Studies have shown that the isolates from health-care associated infections show high resistance to first-line antibiotics. Objective: To describe the resistance patterns of the A. baumannii isolates obtained in a health care institution, the phenotypic characteristics of the isolates, and the possible resistance mechanisms. Materials and methods: A descriptive cross-sectional study was conducted with 28 reports of samples taken from patients hospitalized with infection by A. baumannii . Susceptibility testing for ceftazidime, cefepime, meropenem, amikacin, and ciprofloxacin was performed with the Vitek ™ automated system and the susceptible, intermediate, and resistant classification was based on the protocol established by the Clinical and Laboratory Standards Institute for 2007. Results: The highest percentage of isolates corresponded to males (53.6 %), to the infectology ward (28.5 %), and to the month of September (21.4 %); the most frequent sample site were endotracheal secretions (53.6 %). From the profile patterns for susceptibility to antibiotics used, 13 phylotypes were obtained. Conclusion: Acinetobacter baumannii is a pathogen resistant to multiple antimicrobial agents involved in outbreaks of health-care associated infections. The resistance profile patterns allow inferring that the possible resistance mechanisms present in the majority of the isolates are: Production of extended-spectrum b -lactamases, antibiotic modifying enzymes, and target site modification.

Epidemiología de bacterias nosocomiales resistentes a los antimicrobianos: [revisión] / Epidemiology of nosocomial bacteria resistant to antimicrobials: [review]

Nosocomial infections are a major challenge for public health because of the high rates of morbidity and mortality generated. It was considered that the excessive or inappropriate use of antibiotics triggers the emergence of resistant strains. Among the clinically important bacteria that most commonly cause nososcomial infections, Gram positive multiresistant pathogens stand out such as methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and vancomycin-resistant Enterococcus spp (VRE), and the Gram negative strains of Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Pseudomonas spp. and Acinetobacter baumannii producing expanded spectrum b-lactamases (ESbL). This review describes the behavior of the main bacterial pathogens resistant to antibiotics that cause infections in Europe, United States, and Latin America, emphasizing studies of molecular epidemiology on a global scale, including the major epidemiological studies in Colombia. The genetic structure of S. aureus and Enterococcus spp strains shows a clonal characteristic favored by the predominance of a small number of clones with the capacity to spread globally, due probably to cross-infection. However, the introduction of MRSA strains from the community encourages genetic diversity, tending to establish a genetic polyclonal endemic structure in places like the United States. In Gram negative bacteria, the high genetic diversity among isolates, mainly in Latin American countries, indicates that the polyclonal spread is influenced by horizontal transfer of plasmids, by excessive exposure to antibiotics, and prolonged hospital stays. In Colombia, there is information on nosocomial resistant pathogens, but molecular epidemiological information is still scarce.

Las infecciones nosocomiales constituyen un gran desafío para la salud pública por las altas tasas de morbilidad y mortalidad que generan. Se ha considerado que el uso inapropiado o excesivo de antibióticos desencadena la aparición de cepas resistentes. Entre las bacterias de importancia clínica que con mayor frecuencia causan infecciones nososcomiales, se destacan los patógenos Gram positivos multiresistentes como Staphylococcus aureus con resistencia a meticilina (SARM) y Enterococcus spp. resistentes a vancomicina (ERV). En los Gram negativos, hay resistencia sobre todo con las cepas de Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Pseudomonas spp. y Acinetobacter baumannii productoras de b-lactamasas de espectro extendido (BLEEs, en inglés: ESbL expanded spectrum b-lactamases). Esta revisión tiene como finalidad realizar una decripción del estado de la resistencia bacteriana a los antibióticos en los principales patógenos que causan infecciones nosocomiales en países de Europa, Estados Unidos y de Latinoamérica, destacando los estudios de epidemiología molecular a escala global e incluyendo los principales estudios epidemiológicos realizados en Colombia. La estructura genética de las cepas de Staphylococus aureus y Enterococcus spp. evidencia una característica clonal favorecida por el predominio de un número pequeño de clones con capacidad de diseminarse en forma global, debida probablemente a infecciones cruzadas. Sin embargo, la introducción de cepas SARM desde la comunidad está favoreciendo la diversidad genética, tendiendo a establecerse una estructura genética policlonal en lugares endémicos como los Estados Unidos. En Colombia se dispone de información sobre los patógenos nosocomiales resistentes, pero la información epidemiológica molecular aún es escasa.

Relación entre virulencia y resistencia antimicrobiana en Acinetobacter baumannii: [revisión] / Relationship between virulence and antimicrobial resistance in Acinetobacter baumannii: [review]

Acinetobacter baumanni causa frecuentemente infecciones intrahospitalarias y actualmente se ha relacionado con el desarrollo de infecciones severas adquiridas en la comunidad. La capacidad de colonizar diversos hábitats y la versatilidad en su metabolismo ha influido en el incremento del número de infecciones nosocomiales, siendo responsable del desarrollo de enfermedades como: sepsis, neumonías y meningitis. Estas infecciones aparecen en forma de brotes, dominados por clones epidémicos con multirresistencia a los antibióticos que causan altas tasas de morbilidad y mortalidad. Las Unidades de Cuidados Intensivos son las más afectadas por el uso masivo de antibióticos que ocasiona la aparición de cepas multirresistentes. Es importante estudiar los mecanismos de patogénesis y la resistencia a los antibióticos, como factores directos que determinan el problema de salud. Por otra parte, las islas de patogenecidad que corresponde a material genético exógeno que ha sido integrado al genoma de la bacteria, explicaría en gran medida el carácter patogénico de la bacteria. Estas transportan genes que confieren multirresistencia a los antibióticos y son responsables directos de llevar genes involucrados en mecanismos patogénicos como son: el sistema de captación de hierro, el sistema para la formación de biopelículas en superficies abióticas, el mecanismo de formación de la proteína de membrana externa 38 y los sistemas de secreción de proteínas tipo IV, que han sido demostrados como responsables directos de la patogénesis de diversos patógenos. En este artículo se revisa la situación actual de la incidencia de las infecciones nosocomiales causadas por A. baumannii multirresistente a los antibióticos, los principales mecanismos de resistencia a fármacos y la asociación de ésta con los mecanismos de patogenicidad. El conocimiento de los elementos involucrados en la patogénesis de A. baumannii permitirá establecer los mecanismos que lleven a controlar su diseminación.